Foi fundado em 1719, por ordem do rei, Dom João V, a pedido das Câmaras municipais de Itu e Sorocaba. Seu fundador foi Frei João Batista de Jesus que já se encontrava em Itu como comissário da Ordem Terceira já existente. O atual convento com a igreja anexa é o segundo, construído provavelmente em 1765.

A torre da igreja é de 1863. O último Carmelita de Itu foi Frei Miguel da Conceição Gomes, que faleceu em 1872. O convento serviu, depois, para diversas finalidades: nele esteve instalada a escola chamada «Instituto Novo Mundo», a redação do jornal «O Ituano», o quartel dos soldados da cavalaria e, mais tarde, serviu de convento provisório às Irmãs Sacramentinas de Nossa Senhora das Mercês. Só em 1917 é que os Carmelitas voltaram para Itu.